Ouverte au XIII{{e}} siècle sous le nom de [[rue du Clos Bruneau]], puis rue du Clos Bruneau dite Jean de Beauvais. Elle s'est appelée rue Saint-Jean de Beauvais.
Ancien collège de Beauvais, ouvert par Jean de Dormans, cardinal, évêque de Beauvais et chancelier de France, sous le patronage de Saint-Jean. Le seul reste de ce collège est l'église des Saints-Archanges au numéro 9 de la rue.
Cette rue est présente sur les [[plans de Paris en 1760 et 1771]] (rue Saint-Jean de Beauvais), elle est également présente en l'[[Rues de Paris avant l'an 1450|an 1450]] dans le quatrième quartier de Paris (rue Saint-Jean de Beauvais).